Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria1P23818 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms