Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmt1P23506 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms