Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd8P23463 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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