Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms