Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms