Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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