Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms