Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18530 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18530 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18530 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms