Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata1P17679 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms