Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrphP15331 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrphP15331 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrphP15331 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrphP15331 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrphP15331 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrphP15331 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrphP15331 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrphP15331 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrphP15331 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrphP15331 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrphP15331 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms