Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApcsP12246 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms