Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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