Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem254bP0DN90 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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