Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf1P09925 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms