Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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