Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms