Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06335 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06335 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06335 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06335 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06335 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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