Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06324 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06324 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06324 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06324 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06324 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms