Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01740 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01740 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01740 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01740 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01740 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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