Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Best1O88870 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Best1O88870 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Best1O88870 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Best1O88870 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Best1O88870 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms