Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms