Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms