Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx7O70439 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx7O70439 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx7O70439 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms