Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms