Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sept7O55131 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sept7O55131 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Sept7O55131 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Sept7O55131 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept7O55131 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms