Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms