Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LatO54957 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LatO54957 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LatO54957 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms