Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn5O54942 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms