Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nthl1O35980 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms