Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms