Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl25O35903 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ccl25O35903 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ccl25O35903 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl25O35903 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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