Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1dO35473 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1dO35473 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1dO35473 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1dO35473 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1dO35473 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms