Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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