Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd2O35392 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms