Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ArxO35085 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ArxO35085 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ArxO35085 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms