Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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