Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r88L7N1W8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn2r88L7N1W8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Vmn2r88L7N1W8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r88L7N1W8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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