Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms