Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm8888J3QPX5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm8888J3QPX5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8888J3QPX5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8888J3QPX5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8888J3QPX5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8888J3QPX5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8888J3QPX5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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