Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms