Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms