Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms