Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OpcmlG5E8G3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms