Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms