Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SprtnG3X912 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SprtnG3X912 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms