Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna9G3X8Z7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms