Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms