Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10477F6SW83 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms