Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms