Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms